2008年，我省继续对世界典型强潮河口生态系杭州湾和海湾生态系乐清湾等2个典型生态系统实施监测。监测内容包括初级生产力、生物群落结构及生物多样性、环境状况、生境改变、人为活动影响等。

4.1 杭州湾生态系统

水环境状况处于亚健康状态，主要污染物为无机氮和活性磷酸盐，水体呈严重富营养化状态，氮磷比失衡。沉积环境和海洋生物质量处于健康状态。

栖息地环境处于不健康状态。由于沿岸滩涂围垦和人造堤岸工程等开发活动频繁，杭州湾湿地面积五年减少量大于10%，沉积物主要组分年变化达10.5%。

海洋生物多样性指数偏低，生物群落结构处于不健康状态。2008年杭州湾生态监控区共调查鉴定到浮游植物66种，浮游动物54种，底栖生物58种，潮间带生物61种，采获鱼卵、仔鱼15种。

连续五年的监测结果表明，杭州湾生态系统仍然处于不健康状态。长江、钱塘江径流每年携带大量营养盐等污染物进入杭州湾海域，致使水体长期处于严重富营养化状态，氮磷比失衡。受陆源排污、滩涂围垦和沿岸及河流上游大型工程等影响，杭州湾海域生物多样性下降趋势未得到有效缓解，浮游植物生态群落结构趋向简单；浮游动物生物量逐渐降低，并呈现小型化趋势。底栖生物栖息密度逐年减少；鱼卵、仔鱼种类少，密度低，数量一直处于较低水平。杭州湾沿岸滩涂围垦和人造堤岸的不断增加造成湿地生物生存空间不断缩减，潮间带自然生境受到一定影响。

4.2 乐清湾生态系统

水环境状况处于亚健康状态，主要污染物是无机氮和活性磷酸盐，水体富营养化程度显著，氮磷比失衡。沉积物质量良好，处于健康状态。生物质量总体良好，处于健康状态，但部分生物体内重金属砷、镉和铅的残留量超第一类海洋生物质量标准。

栖息地环境处于亚健康状态。受围垦等海洋工程影响，滨海湿地面积明显减少，近五年来，乐清湾沿岸大量的围、填海工程使乐清湾海涂面积减少20平方千米左右，减少幅度接近10％；水动力条件的改变，导致地形地貌演变加速，沉积物物质组成发生变化，各组分年度变化为5%～10%。

海洋生物多样性指数较低，生物群落结构处于亚健康状态。2008年乐清湾生态监控区共调查鉴定到浮游植物94种，浮游动物119种，底栖生物50种，潮间带生物78种。

连续五年的监测结果表明，乐清湾生态系统基本保持稳定，仍然处于亚健康状态。围填海导致海湾水域面积持续缩小，湾内流场改变，水动力减弱，纳潮量减少，海水交换能力下降。受陆源排污和水动力条件改变的影响，贝类生物体内重金属残留量逐年升高。生物群落结构发生改变，浮游植物、浮游动物和底栖生物多样性指数水平较低。水动力条件的改变，导致冲淤加剧，地形地貌演变加速，沉积物物质组成发生变异，底栖环境发生变化。滩涂围垦和外来物种互花米草入侵，致使湿地面积减少，造成滩涂生物资源锐减和迁徙鸟类栖息地的丧失。