3.1 赤潮

2003年，全市沿海共发现赤潮3起，时间均为5月份，位置分别为台州湾以东附近海域、大陈岛附近海域和东矶列岛附近海域，累计面积达1000多平方公里，均未造成直接经济损失。引起赤潮的浮游生物主要是甲藻类的具齿原甲藻（Prorocentrum dantatum）。

3.2 海洋污损事故

2003年我市发生海洋污损事故1起，但经济损失巨大。11月24至29日，椒江区的三甲、石柱、十塘及路桥区的蓬街、金清等地沿海的滩涂、围塘养殖区内陆续发生鲻鱼、弹涂鱼、青蟹、白虾等水产养殖品大面积死亡事故。受损面积共计48111亩，其中椒江区18911亩、路桥区29200亩，直接经济损失4226万元，其中椒江区3616万元、路桥区610万元。