2003年，莆田海域海水质量总体状况良好，化学需氧量、无机磷、无机氮、铜、镉、汞、砷含量符合清洁海域水质标准；湄洲湾的铅含量符合较清洁海域水质标准；兴化湾、湄洲湾局部受到油类污染。

● 化学需氧量

2003年，莆田海域海水化学需氧量较低，符合清洁海域标准。

● 油类

油类是莆田海域海水主要污染物，除平海湾油类含量符合清洁（较清洁）海域标准外，湄州湾北岸己受到油类轻度污染，兴化湾受到油类中度污染。