2003年，我市发生较大规模的赤潮一起。

11月初，汕头港外发生大规模棕囊藻赤潮（附图：棕囊藻单细胞），面积约几百平方公里。由于棕囊藻属无毒藻类，本次赤潮不会影响水产品的食用安全，网箱养殖没有出现死鱼情况，但由于鱼类粘染赤潮生物后，堵塞了鱼腮引起窒息死亡，导致赤潮发生海域水产品产量锐减，养殖的紫菜和贝类全面失收，造成较大经济损失。由于妈屿岛附近海域近几年来经常发生赤潮，鱼虾贝类明显减少，特别是鳗苗数量明显减少，一些过去比较常见的品种也已很难见到。

（二） 污染事故

2003年，我市发生海洋污染事故一宗。

10月4日，上海籍“浙乐油35号”油船在南澳三点金海域触礁沉没，该船长87米，宽12米，载重3000吨。由于该船为空载返航，因此，本次沉船事故对南澳海域造成的油类污染尚不严重。但是，根据现场取样监测结果，距沉船约100米海域海水的石油类含量为四类和超四类标准，4公里外海域为三类标准，这说明本次沉船事故已对该海域造成一定的油类污染。

（三） 风暴潮灾害

2003年我市受13号台风“杜鹃”外围影响，造成123艘渔船碰损，3418亩鱼塘受灾，直接经济损失4472.1万元。