莆田市属于南亚热带海洋性气候，海岸曲折悠长，岛屿众多，海洋水域广阔，生态类型多样，海洋生物资源丰富。根据有关资料统计，莆田海域大约有浮游生物294种（浮游植物189种，浮游动物105种），底栖生物269种，潮间带生物约300种，脊椎动物鱼类323种（海洋鱼类236种、洄游河口性鱼类21种、淡水鱼类66种）。莆田海域还经常发现有珍稀动物海豚、海豹出没。但目前海洋生物多样性有所下降，有些物种如盛产于兴化湾的栉江珧资源严重衰退。