2004年我国海域共发现赤潮96次，其中渤海12次，黄海13次，东海53次，南海18次，累计面积约26,630平方公里，较上年增加约12,080平方公里。有毒赤潮生物引发的赤潮20余次，面积约7,000平方公里。主要有毒赤潮生物为米氏凯伦藻、棕囊藻等。

赤潮发现次数较上年减少23次，其中渤海持平，黄海增加8次，东海减少33次，南海增加2次。

2004年，影响面积超过1,000平方公里的赤潮事件如下：

●5月13～19日，浙江省渔山列岛附近海域赤潮，面积约1,000平方公里，主要赤潮生物为东海原甲藻。

●5月15日，浙江省中街山海域赤潮，面积约2,000平方公里，主要赤潮生物为具齿原甲藻。

●5月26日，浙江省苍南大渔湾以东海面赤潮，面积约1,000平方公里，主要赤潮生物为具齿原甲藻。

●6月11日，山东省黄河口附近海域赤潮，面积约1,850平方公里，主要赤潮生物为球型棕囊藻，有毒性。

●6月12日，天津市附近海域发生赤潮，面积约3,200平方公里，主要赤潮生物为米氏凯伦藻，有毒性。

●6月11～13日，长江口外至花鸟山、嵊山海域赤潮，面积约1,000 平方公里，主要赤潮生物为具齿原甲藻和中肋骨条藻。

●6月29日，浙江省中南部自舟山虾峙岛至台州列岛以南海域赤潮，总影响面积约2,000 平方公里。

2004年，全海域发现赤潮的次数较上年减少，面积增加，赤潮未对海水养殖业构成明显影响，有毒赤潮未对水产养殖造成影响，经济损失较上年明显减少。