漳州市位于福建省东南部，东临台湾海峡，东北部与厦门市、泉州市相接，西北部紧连龙岩市，西南部与广东省接壤；下辖11县（市、区），其中龙海市、漳浦县、云霄县、东山县和诏安县5县（市）临海。全市陆域面积1.26万平方公里，海岸线715公里，拥有5个主要海湾，沿海大小岛屿135个，毗邻海域面积1.86万平方公里，浅海滩涂面积1123平方公里。

2008年，漳州市海洋与渔业局组织海洋环境监测单位，全面开展近岸海域环境质量趋势性监测、海水增养殖区监测、海水浴场环境质量监测、陆源入海排污口及其邻近海域监测、重点涉海工程海洋环境跟踪监测、海水入侵与盐渍化监测、海洋垃圾、赤潮预警应急监测等工作，监测结果表明：

海水水质，近岸海域大部分海水水质监测指标符合《海水水质标准》（GB3097-1997）中的一类或二类标准，部分监测指标超过海水水质三类或四类标准，主要污染物为无机氮和活性磷酸盐。

近岸沉积物，除诏安湾的汞含量符合《海洋沉积物质量》（GB18668-2002）中的二类标准外，其余监测指标均符合海洋沉积物质量一类标准。

养殖贝类质量，部分养殖贝类体内的铅、砷、镉、滴滴涕和石油烃含量为《海洋生物质量》（GB18421-2001）中的二类标准，其余监测指标符合海洋生物质量一类标准。

海水浴场，马銮湾海水浴场环境状况良好，适宜和较适宜游泳的天数比例为87﹪。

东山湾海水增养殖区大部分水质监测指标符合海水水质一类标准，部分监测指标超标，主要污染物为无机氮，沉积物质量符合海洋沉积物质量一类标准，生物质量符合海洋生物质量一类标准。

排污口及其邻近海域，大部分陆源入海排污口出现污染物超标排放现象，超标污染物有锌、化学需氧物质、悬浮物、石油类和活性磷酸盐等，大部分邻近海域水环境质量不能满足其海洋功能区水质要求。

涉海工程，对全市11个重点涉海工程施工期和营运期实施跟踪监测，大部分涉海工程项目按照环境影响报告书的要求采取环保措施，但个别涉海工程未按环保要求进行施工，影响了周边海洋环境。

海洋垃圾，开展了东山马銮湾海水浴场区域海面漂浮垃圾和海滩垃圾监测工作，结果表明，垃圾种类均以塑料类为主。

2008年9月，强台风“黑格比”（0814号）在广东省电白县附近海面登陆，东山县和诏安县受到一定影响，但未造成较大的损失；11月诏安湾海域发生赤潮，赤潮生物种为棕囊藻（Phaeocystis pouchetii），未造成海水养殖业经济损失。

海水入侵及土壤盐渍化，开展漳浦旧镇梅宅村和漳浦霞美镇刘坂村两个区域监测，结果表明，两个区域地下水氯度和矿化度较高；土壤中含盐量较高，漳浦旧镇梅宅村土壤偏酸性（pH值5.96），漳浦霞美镇刘板村土壤偏碱性（pH值8.07）。