2009年，连云港市海洋与渔业局依照《江苏赤潮防灾减灾工作方案》继续对海州湾海域开展了赤潮监视监测，于5月～10月赤潮高发期在国控点（海州湾赤潮监控区）和省控点（临洪河口赤潮监控区）开展了高频率、高密度的监视与监测，共开展常规监测24次。

7月18日～23日，在海州湾发生面积近210平方公里的赤潮。主要赤潮生物种类为凯伦藻，密度达（2.39～3.18）×10⁷个/L。该种类为有毒藻类，在近岸引起了部分鱼类死亡。赤潮发生后连云港市海洋与渔业局立即启动了应急预案，连云港市海洋环境监测中心随即开展了应急监测。及时发布了赤潮发生、发展相关的信息，采取了积极有效的应对措施。该赤潮未造成明显的直接经济损失，也未发生食用海产品而引起人员中毒的事件。

2004年～2009年连云港近岸赤潮发生面积变化趋势

2004年～2009年连云港近岸赤潮发生情况汇总表