海岛保护规划制度是《海岛保护法》确立的核心制度之一，是从事海岛保护、利用活动的依据。2011年，海岛保护规划编制取得显著进展，初步建立了以全国海岛保护规划、省级海岛保护规划和县市可开发利用无居民海岛保护和利用规划（单岛规划）三个层次构成的海岛规划体系。

为加强对省级海岛保护规划的技术指导，印发了《关于编制省级海岛保护规划的若干意见》和《省级海岛保护规划编制技术导则（试行）》，规定了省级海岛保护规划的编制要求、技术方法等。举办了两期省级海岛保护规划编制培训班，19家海岛保护规划编制技术单位共120余人次参加了培训。

《全国海岛保护规划》已报国务院审批。浙江、广东、广西三省（区）批准实施了省级海岛保护规划，福建省海岛保护规划已报省政府审批，其他沿海各省也启动了规划编制工作。