长江河口区浮游植物和浮游动物种类数量逐年下降（图7）。与90年代初相比，浮游植物种类减少了一半，浮游动物种类减少约60%。5月底栖动物种类数仅为20世纪80年代初的20%左右。长江口门区浮游生物种类丰富，近10年种类数基本变化不大。整个长江口区海洋生物群落结构趋于简单，生物多样性逐年下降，密度和生物量都很低。产卵场退化，鱼卵、仔鱼种类少，密度低。

长江流域大型水利工程建设导致长江口淡水和泥沙入海量减少，淡水入海量减少20%以上，长江口北支0米以下的河槽容积减少了近60%。近3年间围垦总面积1万多公顷，潮滩湿地资源损失严重。

河口航道整治、陆源排污、滩涂围垦等开发活动对长江口生态系统健康产生了主要影响。

大洋海水的N/P值一般接近16/1，即Redfield比值，浮游植物对营养盐的吸收基本上接近这个比例进行。当海域营养盐体系发生某种变动时，这种比值也会因此面改变，进而影响海洋环境的生态平衡。

4.2 上海市杭州湾北岸生态监控区

该海域无机氮和活性磷酸盐含量均超四类海水水质标准。 5月和8月富营养化指数平均值分别为12和20，水体严重富营养化；氮磷比失衡，5月和8月氮磷比分别为48和27。

全年共鉴定浮游植物28种，浮游动物38种，底栖生物17种。多样性指数值较低。主要渔业资源种类共鉴定59种，其中鱼类29种，虾类13种，蟹类10种，贝类5种，头足类和水母类各1种。

自1987年至2004年，杭州湾北岸上海岸段共围垦滩涂面积约3700公顷（图8）。随着长江来沙的减少，该岸段受到侵蚀的趋势将会加剧，海岸工程的防护和潮滩湿地生态系统的修复受到一定的影响。

陆源排污、过度捕捞以及长江来沙量减少等是导致杭州湾北岸海域生态系统不稳定的主要因素。