2004年，在继续开展海洋环境质量趋势性监测、赤潮监控区监测、重点海水浴场监测、海洋自然保护区监测的基础上，加强了河流污染物入海和沿岸排污口污染物排海的监测，首次开展了海水增养殖区、近岸生态监控区监测。

监测结果表明，我区近岸大部分海域环境质量继续保持优良状态。绝大部分海域为清洁海域和较清洁海域；海域的海洋沉积物、海洋生物质量基本保持良好状态；近岸典型生态系统基本健康；海洋功能区的海水水质能满足其使用功能的要求；海洋自然保护区内的珍稀濒危物种和生态环境得到有效保护。但随着我区海洋开发力度不断加大，海洋环境受到了一定程度的影响。

2004年，我区发现一起赤潮，但经济损失不大。全年未发生风暴潮灾害。