5.1 赤潮

2005年，全市沿海共发现赤潮4起，时间为6月，集中在椒江大陈岛附近海域、玉环坎门海域、温岭石塘海域和三门近岸海域，累计面积达180多平方公里，赤潮生物主要为长崎裸甲藻(Gymnodinium mikimotoi )（有毒性）和具齿原甲藻(Prorocentrum dentatum stein)。水产养殖业损失约75万元。

2005年影响我市的风暴潮较多，较为严重的有3次，分别为0505（海棠）、0509（麦莎）0515（卡努），其中0509号“麦莎”于8月6日03时40分在我市玉环县干江镇登陆，0515号“卡努”于9月11日14时50分在我市路桥区金清镇登陆。受台风影响，我市共造成直接经济损失110亿元；受灾人口784.91万人次，死亡10人；房屋倒塌1910间；水产养殖损失量7.9万吨；沉船40艘；损坏堤防288.62千米。

5.3 渔业污染事故

今年我市发生了数起渔业污染事故，最严重的是温岭市石塘养殖区的贝类大面积死亡，直接经济损失达90多万元。